新抗原(neoantigen),即突變蛋白產生的抗原和致瘤病毒整合進基因組產生的抗原，屬于腫瘤特異性抗原范疇。本節著重闡述在腫瘤細胞形成過程中，由正常基因突變產生的抗原。隨著基因組學、蛋白質組學的發規，人們可利用生物信息學的方法對突變的基因進行分析，預測出可能和MHC結合的對應肽段，即對應的抗原表位，其被T細胞識別后，發揮特異性殺傷作用。有研究表明，在小鼠和人體內CD4+和CD8+T細胞都能特異性識別新抗原表位。新抗原為腫瘤特異性抗原，正常組織不表達，并且無中樞性T細胞耐受性，是近年來腫瘤抗原領域最受矚目的抗原類別。

腫瘤細胞的突變在各系統腫瘤中的頻率高低有別，在黑色素瘤、肺癌、食管癌、胃癌、腸癌等腫瘤組織中有較髙水平的突變。以新抗原為基礎的個體化免疫治療有以下幾種模式(圖3-1)。一是新抗原作為腫瘤治療性疫苗，包括肽疫苗、RNA疫苗、DC疫苗等形式，誘發和增強體內針對這類特異性抗原的免疫反應，從而去殺傷表達這類抗原的靶細胞。有研究表明，荷瘤小鼠體內注射新抗原疫苗，可控制腫瘤增長。 Carreno等發現，利用新抗原制備的腫瘤疫苗，其既可以產生對新抗原的主動免疫，又能增強T細胞的抗腫瘤效應。這為新抗原制備腫瘤疫苗進一步走向臨床提供了依據。二是以新抗原為基礎的過繼性細胞免疫治療，包括分選擴增新抗原特異性T細胞、獲取新抗原特異性T細胞的TCR 轉染T細跑、制備針對腫瘤表面提呈的新抗原的CAR-T細胞等。目前，新抗原為基礎的過繼性細跑免疫治療在惡性黑色素瘤、淋巴瘤、卵巢癌及膽管癌中取得較好的療效。 2014年，Rosenberg團隊通過對病灶的全基因組測序篩選出可能的新抗原，制備特異性T 細跑治療一名轉移性膽管癌患者，該患者在治療一周期后就達到了部分緩解。三是新抗原與其他常規祌瘤治療模式的聯合，如腫瘤放射治療、化療、免疫卡控點阻滯劑等，增加新抗原在免疫系統的暴露，調節腫瘤免疫微環境，發揮協同作用。無論使用何種策略、何種模式來增強腫瘤特異性T細胞反應性，靶向多個新抗原顯得至關重要，以防止腫瘤細胞通過改變涉及的突變表位，發生腫瘤逃逸。此外，還需避免靶向自身免疫疾病相關的突變基因，以免誘導或加重癌癥相關的自身免疫性疾病。

目前臨床較常見，研究較多的突變基因是EGFR和KRAS。EGFR基因由28個外顯子組成，編碼1186個氨基酸，位于人類染色體7p13—q22區，其編碼的蛋白是ErbB受體家族的成員之一，位于細胞表面，能被特異性的配體如表皮生長因子激活。目前已知的EGFR基因突變常見于第19位外顯子的缺失、L858R、T790M、G719X、L861Q、S768I、第20 位外顯子的插入等，以前兩者居多，占所有突變的90%，這些突變引起EGFR蛋白過表達或活性過強，可能與多種惡性腫瘤的發生有關，包括非小細胞肺癌、直腸癌、多形性膠質細胞瘤等。因此，EGFR基因突變可以作為惡性腫瘤治療的靶標。

Kras基因是一種原癌基因，長約35kb，位于12號染色體，是ras基因家族成員之一，編碼Kras蛋白。Kras基因分為突變型和野生型，常見的突變位點位于Kras基因2號外顯子的12號密碼子和13號密碼子及3號外顯子的61號密碼子,其中有7個突變熱點：G12C、 G12R、G12S、G12V、G12D、G12A、G13V/D,占 Kras基因總突變的90%以上。據報道，體細胞Kras基因突變與多種人類惡性腫瘤，如肺癌、白血病、胰腺癌、結直腸癌等有關。近年來，有研究表明，通過噬菌體肽庫展示技術制備出針對KRAS G12VHLA限制性的胞外段的抗體，有望進一步設計出針對KRAS G12V突變位點HLA限制性的CAR-T,可能有很好的臨床應用前景。